MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia phymatum STM815 chromosome 2

Total Repeats: 58287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010623	GAT	2	6	31	36	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186471974
2	NC_010623	CGCC	2	8	69	76	0 %	0 %	25 %	75 %	186471974
3	NC_010623	CCG	2	6	83	88	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471974
4	NC_010623	CGCC	2	8	183	190	0 %	0 %	25 %	75 %	186471974
5	NC_010623	GCT	2	6	214	219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471974
6	NC_010623	CGTC	2	8	228	235	0 %	25 %	25 %	50 %	186471974
7	NC_010623	GAC	2	6	247	252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471974
8	NC_010623	GC	3	6	264	269	0 %	0 %	50 %	50 %	186471974
9	NC_010623	ATG	2	6	285	290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186471974
10	NC_010623	CCG	2	6	291	296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471974
11	NC_010623	CCG	2	6	323	328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471974
12	NC_010623	GC	3	6	336	341	0 %	0 %	50 %	50 %	186471974
13	NC_010623	CCG	2	6	356	361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471974
14	NC_010623	CCG	2	6	372	377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471974
15	NC_010623	CG	3	6	405	410	0 %	0 %	50 %	50 %	186471974
16	NC_010623	CG	3	6	426	431	0 %	0 %	50 %	50 %	186471974
17	NC_010623	GCC	2	6	433	438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471974
18	NC_010623	TCGA	2	8	482	489	25 %	25 %	25 %	25 %	186471974
19	NC_010623	CGA	2	6	526	531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471974
20	NC_010623	GCCC	2	8	564	571	0 %	0 %	25 %	75 %	186471974
21	NC_010623	CGTGGC	2	12	580	591	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	186471974
22	NC_010623	CGG	3	9	605	613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471974
23	NC_010623	CATTGT	2	12	616	627	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186471974
24	NC_010623	CG	3	6	767	772	0 %	0 %	50 %	50 %	186471975
25	NC_010623	CGC	2	6	866	871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471975
26	NC_010623	CGA	2	6	928	933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471975
27	NC_010623	TGATAG	2	12	993	1004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186471975
28	NC_010623	GCA	2	6	1066	1071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471975
29	NC_010623	TCG	2	6	1101	1106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471975
30	NC_010623	GTC	2	6	1139	1144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471975
31	NC_010623	GCG	2	6	1151	1156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471975
32	NC_010623	GAT	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186471975
33	NC_010623	CAT	2	6	1267	1272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186471975
34	NC_010623	CG	3	6	1294	1299	0 %	0 %	50 %	50 %	186471975
35	NC_010623	GTT	2	6	1385	1390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186471975
36	NC_010623	GC	3	6	1643	1648	0 %	0 %	50 %	50 %	186471976
37	NC_010623	CATC	2	8	1658	1665	25 %	25 %	0 %	50 %	186471976
38	NC_010623	CG	3	6	1682	1687	0 %	0 %	50 %	50 %	186471976
39	NC_010623	TGA	2	6	1711	1716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186471976
40	NC_010623	CG	3	6	1758	1763	0 %	0 %	50 %	50 %	186471976
41	NC_010623	CG	3	6	1768	1773	0 %	0 %	50 %	50 %	186471976
42	NC_010623	GACG	2	8	1943	1950	25 %	0 %	50 %	25 %	186471976
43	NC_010623	CTG	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471976
44	NC_010623	TCG	2	6	1974	1979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471976
45	NC_010623	TGC	2	6	1999	2004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471976
46	NC_010623	CGA	2	6	2036	2041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471976
47	NC_010623	CTG	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471976
48	NC_010623	TGC	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471976
49	NC_010623	GCTCG	2	10	2201	2210	0 %	20 %	40 %	40 %	186471976
50	NC_010623	CGC	2	6	2486	2491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471976
51	NC_010623	GCC	2	6	2526	2531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471976
52	NC_010623	GCCG	2	8	2634	2641	0 %	0 %	50 %	50 %	186471977
53	NC_010623	GCG	2	6	2643	2648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471977
54	NC_010623	CTG	2	6	2665	2670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471977
55	NC_010623	GGC	2	6	2690	2695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471977
56	NC_010623	CG	4	8	2760	2767	0 %	0 %	50 %	50 %	186471977
57	NC_010623	CGC	2	6	2801	2806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471977
58	NC_010623	GC	3	6	2818	2823	0 %	0 %	50 %	50 %	186471977
59	NC_010623	CG	3	6	2830	2835	0 %	0 %	50 %	50 %	186471977
60	NC_010623	GC	3	6	2846	2851	0 %	0 %	50 %	50 %	186471977
61	NC_010623	CGC	2	6	2878	2883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471977
62	NC_010623	GCC	2	6	2891	2896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471977
63	NC_010623	CGA	3	9	2913	2921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471977
64	NC_010623	ACC	2	6	2948	2953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186471977
65	NC_010623	CG	5	10	3069	3078	0 %	0 %	50 %	50 %	186471977
66	NC_010623	CAG	3	9	3091	3099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471977
67	NC_010623	GGCG	2	8	3112	3119	0 %	0 %	75 %	25 %	186471977
68	NC_010623	GC	3	6	3135	3140	0 %	0 %	50 %	50 %	186471977
69	NC_010623	CGG	2	6	3144	3149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471977
70	NC_010623	CAG	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471977
71	NC_010623	GC	5	10	3171	3180	0 %	0 %	50 %	50 %	186471977
72	NC_010623	ATCG	2	8	3193	3200	25 %	25 %	25 %	25 %	186471977
73	NC_010623	CCG	2	6	3462	3467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471978
74	NC_010623	AGC	2	6	3469	3474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471978
75	NC_010623	CGA	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471978
76	NC_010623	CAT	2	6	3483	3488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186471978
77	NC_010623	GGC	2	6	3507	3512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471978
78	NC_010623	CCT	2	6	3608	3613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186471978
79	NC_010623	GCCG	2	8	3659	3666	0 %	0 %	50 %	50 %	186471978
80	NC_010623	ACGC	2	8	3677	3684	25 %	0 %	25 %	50 %	186471978
81	NC_010623	GCA	2	6	3685	3690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471978
82	NC_010623	GCG	2	6	3778	3783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471979
83	NC_010623	GCG	2	6	3797	3802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471979
84	NC_010623	CGA	2	6	3815	3820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471979
85	NC_010623	GC	3	6	3871	3876	0 %	0 %	50 %	50 %	186471979
86	NC_010623	GCG	2	6	3889	3894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471979
87	NC_010623	CGG	2	6	3911	3916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471979
88	NC_010623	GGC	2	6	3921	3926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471979
89	NC_010623	GCT	2	6	3946	3951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471979
90	NC_010623	CTG	2	6	3953	3958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471979
91	NC_010623	GCC	2	6	4064	4069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471980
92	NC_010623	GGC	2	6	4094	4099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471980
93	NC_010623	CG	3	6	4100	4105	0 %	0 %	50 %	50 %	186471980
94	NC_010623	CGC	3	9	4124	4132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471980
95	NC_010623	TCG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471980
96	NC_010623	CGC	2	6	4361	4366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471980
97	NC_010623	GC	3	6	4365	4370	0 %	0 %	50 %	50 %	186471980
98	NC_010623	CG	3	6	4398	4403	0 %	0 %	50 %	50 %	186471980
99	NC_010623	CG	3	6	4611	4616	0 %	0 %	50 %	50 %	186471980
100	NC_010623	CGA	2	6	4643	4648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471980
101	NC_010623	CGACG	2	10	4688	4697	20 %	0 %	40 %	40 %	186471980
102	NC_010623	GGC	2	6	4698	4703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471980
103	NC_010623	GCG	2	6	4737	4742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471980
104	NC_010623	CG	3	6	4872	4877	0 %	0 %	50 %	50 %	186471980
105	NC_010623	GTT	2	6	4913	4918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186471980
106	NC_010623	ATC	2	6	5107	5112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186471981
107	NC_010623	GCA	2	6	5120	5125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471981
108	NC_010623	CGC	3	9	5158	5166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471981
109	NC_010623	CGGCG	2	10	5335	5344	0 %	0 %	60 %	40 %	186471981
110	NC_010623	CGC	2	6	5374	5379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471981
111	NC_010623	GC	3	6	5400	5405	0 %	0 %	50 %	50 %	186471981
112	NC_010623	GCT	2	6	5437	5442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471981
113	NC_010623	ACG	2	6	5465	5470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471981
114	NC_010623	CGT	2	6	5476	5481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471981
115	NC_010623	GCA	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471981
116	NC_010623	GCGG	2	8	5546	5553	0 %	0 %	75 %	25 %	186471981
117	NC_010623	TCG	2	6	5649	5654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471981
118	NC_010623	CCG	2	6	5680	5685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471981
119	NC_010623	CGC	2	6	5719	5724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471981
120	NC_010623	CGACG	2	10	5749	5758	20 %	0 %	40 %	40 %	186471981
121	NC_010623	CTG	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471981
122	NC_010623	CTT	2	6	5791	5796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186471981
123	NC_010623	CGCGCT	2	12	5884	5895	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	186471981
124	NC_010623	GGCT	2	8	5933	5940	0 %	25 %	50 %	25 %	186471981
125	NC_010623	CGG	2	6	5941	5946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471981
126	NC_010623	CAG	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471981
127	NC_010623	GGCT	2	8	5972	5979	0 %	25 %	50 %	25 %	186471981
128	NC_010623	GCGCG	2	10	5989	5998	0 %	0 %	60 %	40 %	186471981
129	NC_010623	TTC	2	6	6011	6016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186471981
130	NC_010623	CTG	2	6	6017	6022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471981
131	NC_010623	CGT	2	6	6151	6156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471981
132	NC_010623	CCA	2	6	6166	6171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186471981
133	NC_010623	GGC	2	6	6200	6205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471981
134	NC_010623	CGACG	2	10	6214	6223	20 %	0 %	40 %	40 %	186471981
135	NC_010623	CGC	2	6	6271	6276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471981
136	NC_010623	TGC	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471981
137	NC_010623	CGA	2	6	6295	6300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471981
138	NC_010623	CTT	2	6	6518	6523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186471982
139	NC_010623	GAAT	2	8	6531	6538	50 %	25 %	25 %	0 %	186471982
140	NC_010623	CG	3	6	6604	6609	0 %	0 %	50 %	50 %	186471982
141	NC_010623	CGA	2	6	6674	6679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471982
142	NC_010623	GCA	2	6	6689	6694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471982
143	NC_010623	TCG	2	6	6729	6734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471982
144	NC_010623	CGA	2	6	6743	6748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471982
145	NC_010623	GCG	2	6	6764	6769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471982
146	NC_010623	GC	3	6	6777	6782	0 %	0 %	50 %	50 %	186471982
147	NC_010623	GC	3	6	6785	6790	0 %	0 %	50 %	50 %	186471982
148	NC_010623	GTC	2	6	6827	6832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471982
149	NC_010623	CG	3	6	6856	6861	0 %	0 %	50 %	50 %	186471982
150	NC_010623	TCG	2	6	6870	6875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471982
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154	NC_010623	CGG	3	9	6988	6996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471982
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156	NC_010623	ATG	2	6	7116	7121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186471982
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162	NC_010623	TCG	2	6	7503	7508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471983
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258	NC_010623	GCGA	2	8	11210	11217	25 %	0 %	50 %	25 %	186471988
259	NC_010623	CTG	2	6	11228	11233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471988
260	NC_010623	GCTGGA	2	12	11277	11288	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	186471988
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262	NC_010623	CGT	2	6	11365	11370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471988
263	NC_010623	CG	3	6	11375	11380	0 %	0 %	50 %	50 %	186471988
264	NC_010623	GGC	2	6	11415	11420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471988
265	NC_010623	GTG	2	6	11426	11431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186471988
266	NC_010623	GTGAC	2	10	11458	11467	20 %	20 %	40 %	20 %	186471988
267	NC_010623	CGC	2	6	11495	11500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471989
268	NC_010623	TCG	3	9	11507	11515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471989
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270	NC_010623	GTC	2	6	11628	11633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471989
271	NC_010623	CGT	2	6	11651	11656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471989
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278	NC_010623	GAC	2	6	11911	11916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471989
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281	NC_010623	CGC	2	6	11958	11963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471989
282	NC_010623	CGA	2	6	11970	11975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186471989
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288	NC_010623	CCG	2	6	12327	12332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186471989
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299	NC_010623	CTG	2	6	12847	12852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471990
300	NC_010623	CG	3	6	12894	12899	0 %	0 %	50 %	50 %	186471990
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389	NC_010623	GA	3	6	17347	17352	50 %	0 %	50 %	0 %	186471993
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392	NC_010623	GCT	2	6	17703	17708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186471994
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394	NC_010623	GGC	2	6	17746	17751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186471994
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